Comparer for protein structure rankings

Qian, J. et.al (2001) Nucleic Acids Research 29: 1750-64

[First 30 records][Entire table] [Display values][Display ranks] Image size: [50][70][100][120]		Q(foldonly) P-value (seq. DE)	F(cdc28) fluctuation of expression levels in CDC28	X(age) year of fold determined	B(Ala, pdb100) composition percentage of Ala for pdb100d	J(scerall,intra) interaction on same chains [yeast]
Max in column		56	126	420	420	112
Min in column		1	1	1	1	1
Average		5.6	62.0	192.0	208.5	58.3
Non zero hits		56	126	420	420	132
Ranked folds (click on arrows to re-rank)
d1hcc__:. (1.39)		.	.	306	420	.
d1ncfb3:. (1.39)		.	.	187	419	.
d1tbo__:. (1.39)		.	29	119	418	.
d1a68__:. (1.39)		.	.	1	417	.
d1puc__:. (1.39)		.	56	223	416	.
d1tpg_2:. (1.39)		.	.	223	414	.
d1who__:. (1.39)		1	56	285	414	82
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d1zqw__:. (1.39)		.	.	223	411	60
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d1wkt__:. (1.39)		.	.	255	408	.
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d1gpl_1:. (1.39)		1	.	223	406	.
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d2bbg__:. (1.39)		.	.	1	402	.
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d1ema__:. (1.39)		.	.	56	400	.
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d7ahla_:. (1.39)		.	.	56	395	.
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d1mnma_:. (1.39)		.	.	119	394	.
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d1eft_2:. (1.39)		.	.	223	390	.
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d1sp2__:. (1.39)		.	35	332	390	.
d1aol__:. (1.39)		.	.	9	388	.
d1a26_1:. (1.39)		.	.	56	388	.
d1hcd__:. (1.39)		1	38	332	386	34
d1a1x__:. (1.39)		.	.	9	386	.
d2viua_:. (1.39)		.	.	332	385	.
d1azo__:. (1.39)		.	.	285	381	.
d2nef__:. (1.39)		.	.	56	381	24
d1ospo_:. (1.39)		.	.	56	381	.
d1ap8__:. (1.39)		.	.	9	381	1
d1kdu__:. (1.39)		.	.	285	378	.
d1auz__:. (1.39)		1	.	9	378	.
d1blj__:. (1.39)		.	.	255	378	.
d1ois__:. (1.39)		.	.	56	372	82
d5csma_:. (1.39)		.	.	187	372	.
d1pkm_1:. (1.39)		.	.	396	372	.
d1rot__:. (1.39)		1	23	285	372	.
d2chsa_:. (1.39)		1	.	187	372	.
d1bgw__:. (1.39)		.	.	56	372	.
d1hc2_1:. (1.39)		.	.	285	370	.
d1eur__:. (1.39)		.	.	285	370	82
d1cp3a_:. (1.39)		.	.	187	369	112
d2cba__:. (1.39)		.	.	377	365	.
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d2lbd__:. (1.39)		.	29	56	365	.
d1rlaa_:. (1.39)		.	.	56	365	112
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d1cld__:. (1.39)		.	.	255	360	60
d1acc__:. (1.39)		.	.	9	360	.
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d1slua_:. (1.39)		.	.	56	360	.
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d1clh__:. (1.39)		.	15	255	354	60
d1uxy_1:. (1.39)		.	.	119	354	.
d1a3ga_:. (1.39)		.	56	119	354	.
d1tih__:. (1.39)		.	.	381	354	.
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d1a6q__:. (1.39)		.	44	1	351	.
d2dtr_2:. (1.39)		.	.	119	351	.
d1aaf__:. (1.39)		.	35	306	351	.
d1an7a_:. (1.39)		.	.	56	347	112
d1ecib_:. (1.39)		.	.	119	347	.
d1fid__:. (1.39)		.	49	56	347	.
d1aoo__:. (1.39)		.	.	306	347	.
d1axx__:. (1.39)		.	75	306	342	.
d1ajw__:. (1.39)		52	109	403	342	112
d1gnd_2:. (1.39)		.	.	354	342	20
d1ps2__:. (1.39)		.	38	223	342	.
d1lci__:. (1.39)		.	7	56	342	60
d1hmy__:. (1.39)		.	44	223	338	.
d1tis__:. (1.39)		.	.	285	338	82
d1mkaa_:. (1.39)		.	.	56	338	.
d1eal__:. (1.39)		.	68	306	338	.
d1har__:. (1.39)		.	116	354	334	82
d1cmba_:. (1.39)		.	.	255	334	.
d1tif__:. (1.39)		1	119	354	334	60
d1zfo__:. (1.39)		.	.	255	334	.
d1kifa1:. (1.39)		.	.	223	331	.
d1tbd__:. (1.39)		.	.	56	331	.
d1bme__:. (1.39)		.	.	119	331	.
d2minb_:. (1.39)		.	.	223	324	.
d2rig__:. (1.39)		.	.	285	324	112
d1a74a_:. (1.39)		.	.	1	324	.
d1coo__:. (1.39)		.	.	119	324	.
d1bet__:. (1.39)		.	.	255	324	.
d1aj6__:. (1.39)		.	101	9	324	.
d1gp2g_:. (1.39)		1	.	56	324	.
d1szt__:. (1.39)		.	.	332	315	60
d1auia_:. (1.39)		.	91	119	315	.
d1bgp__:. (1.39)		.	101	372	315	.
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d1pty__:. (1.39)		.	85	187	315	112
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d1lnh_1:. (1.39)		.	.	223	315	.
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d3vub__:. (1.39)		1	25	255	310	.
d1une__:. (1.39)		.	.	392	310	.
d1sfta1:. (1.39)		1	.	56	310	82
d2fmr__:. (1.39)		.	14	119	310	45
d1kst__:. (1.39)		.	75	285	307	.
d3lck__:. (1.39)		.	101	255	307	.
d1pmd_3:. (1.39)		.	.	56	307	.
d1ap0__:. (1.39)		1	.	306	302	.
d1npoa_:. (1.39)		.	.	306	302	.
d1bak__:. (1.39)		.	88	187	302	.
d1dhx__:. (1.39)		.	.	374	302	.
d1fgp__:. (1.39)		.	.	56	302	.
d1lis__:. (1.39)		.	.	223	297	.
d1dst__:. (1.39)		.	97	412	297	7
d1gne_1:. (1.39)		.	60	255	297	24
d1wer__:. (1.39)		.	60	56	297	.
d1gpma3:. (1.39)		.	.	119	297	.
d1kwaa_:. (1.39)		.	56	56	295	34
d1nsya_:. (1.39)		1	111	332	295	60
d1apj__:. (1.39)		.	.	9	291	.
d1ytfd1:. (1.39)		.	.	56	291	82
d1yna__:. (1.39)		.	97	412	291	.
d1agre_:. (1.39)		.	101	9	291	45
d2cae__:. (1.39)		.	.	377	286	82
d1plq_2:. (1.39)		.	.	255	286	.
d1auua_:. (1.39)		1	.	374	286	.
d1bgk__:. (1.39)		.	.	56	286	.
d1cby__:. (1.39)		.	.	119	286	.
d1bax__:. (1.39)		.	.	119	278	.
d1mut__:. (1.39)		.	68	119	278	112
d2bnh__:. (1.39)		.	10	56	278	7
d1yua_2:. (1.39)		.	.	119	278	112
d1dyr__:. (1.39)		.	.	381	278	.
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d1lbea_:. (1.39)		.	.	56	278	.
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d1bco_1:. (1.39)		.	.	119	246	.
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d1bmta1:. (1.39)		1	.	306	218	.
d1gtqa_:. (1.39)		.	.	119	218	112
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d1kxu_2:. (1.39)		.	49	56	212	.
d2reb_2:. (1.39)		.	.	285	212	.
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d1ak7__:. (1.39)		.	101	187	212	.
d1akz__:. (1.39)		.	.	119	209	.
d1tcp__:. (1.39)		.	19	392	209	.
d1aa7a_:. (1.39)		.	.	9	209	10
d1vii__:. (1.39)		.	.	9	204	.
d1rlr_2:. (1.39)		.	81	187	204	18
d3pfk__:. (1.39)		.	.	346	204	.
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d1cyx__:. (1.39)		.	.	396	200	27
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d1lre__:. (1.39)		.	.	9	187	.
d1fps__:. (1.39)		.	.	187	187	112
d1lay__:. (1.39)		.	.	56	187	45
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d2end__:. (1.39)		.	.	187	180	.
d1pysa_:. (1.39)		.	26	255	180	.
d1rmg__:. (1.39)		1	.	223	180	.
d1pya.1a:. (1.39)		.	.	255	180	.
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d1avc__:. (1.39)		.	.	285	172	.
d1jdbc2:. (1.39)		.	.	119	172	.
d1aop_4:. (1.39)		.	.	9	172	.
d1lcpa1:. (1.39)		.	.	306	172	.
d1fts_1:. (1.39)		.	.	56	172	20
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d1lba__:. (1.39)		.	.	223	170	.
d1dun__:. (1.39)		1	38	119	162	.
d1neda_:. (1.39)		.	94	187	162	.
d2itg__:. (1.39)		1	35	400	162	60
d1am9a_:. (1.39)		.	.	187	162	.
d1froa_:. (1.39)		.	.	119	162	.
d2xat__:. (1.39)		.	29	119	162	.
d1oaca4:. (1.39)		.	.	119	162	82
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d2pgd_1:. (1.39)		.	.	187	154	.
d1ecra_:. (1.39)		.	.	56	154	.
d1agi__:. (1.39)		.	.	372	154	.
d1fsz_1:. (1.39)		.	.	9	154	12
d1phr__:. (1.39)		1	.	187	154	.
d1jhga_:. (1.39)		.	.	354	154	.
d1alq__:. (1.39)		.	91	306	154	.
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d1trla_:. (1.39)		.	.	381	149	.
d1gsa_1:. (1.39)		.	.	223	149	.
d1soxa3:. (1.39)		.	.	9	149	.
d1llc_2:. (1.39)		.	97	417	149	.
d1a6ja_:. (1.39)		.	.	1	149	.
d1ayl__:. (1.39)		.	.	119	147	.
d1svb_2:. (1.39)		.	.	119	147	.
d2cts__:. (1.39)		.	29	374	144	.
d1mat__:. (1.39)		.	.	255	144	.
d1vnc__:. (1.39)		.	.	119	144	.
d1jdc_1:. (1.39)		.	81	381	138	.
d1adt_3:. (1.39)		.	.	119	138	60
d1hoe__:. (1.39)		.	.	332	138	.
d2ifo__:. (1.39)		1	.	354	138	.
d1aijh1:. (1.39)		.	.	346	138	27
d1fim__:. (1.39)		.	.	119	138	45
d1kpta_:. (1.39)		.	.	119	134	82
d1a91__:. (1.39)		.	.	346	134	.
d1ojt_2:. (1.39)		.	29	354	134	.
d1gtra1:. (1.39)		.	101	306	134	.
d1a4sa_:. (1.39)		.	44	56	128	.
d1vpe__:. (1.39)		.	.	403	128	.
d1a8e__:. (1.39)		.	.	306	128	.
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d1ojt_3:. (1.39)		.	23	346	128	.
d1ecl__:. (1.39)		.	.	119	128	.
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d1trka3:. (1.39)		.	.	223	72	60
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d1vhh__:. (1.39)		.	.	119	72	112
d1pkm_3:. (1.39)		.	81	396	72	.
d1jfo__:. (1.39)		.	.	223	72	.
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d1efva2:. (1.39)		.	.	56	70	.
d1pmc__:. (1.39)		.	.	119	70	.
d1cdda_:. (1.39)		.	.	255	65	.
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d1vib__:. (1.39)		.	.	119	23	.
d1tml__:. (1.39)		.	.	306	21	5
d1gab__:. (1.39)		.	.	392	21	.
d1fsu__:. (1.39)		.	94	223	19	.
d2chr_2:. (1.39)		.	.	306	19	.
d2prk__:. (1.39)		.	17	420	17	60
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d1rkd__:. (1.39)		1	52	9	15	34
d1lbu_1:. (1.39)		.	.	56	15	.
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d1pprm2:. (1.39)		.	.	56	2	.
d1aep__:. (1.39)		.	.	255	2	.
d1ctf__:. (1.39)		.	.	368	1	.

The images of protein structures were taken from www.rcsb.org
The classification of folds is from SCOP version 1.39

Questions, comments, and suggestions qian@csb.yale.edu