Report on Structure d1aj2_

Report on SCOP Fold corresponding to representative domain d1aj2__ [SCOP 1.39 Fold 3.001]

Interaction Report for Fold 3.001

Function Classification

Augmented Flybase+ENZYME GenProtEC MIPS
d1aj2__ E-2.5.1.15 NO NO

Rankings

O C C U R R E N C E S

Species 20 Aful Mjan Mthe Phor Scer Cele Aaeo Syne Ecol Bsub Mtub Hinf Hpyl Mgen Mpne Bbur Tpal Ctra Cpne Rpro

Number 858 45 37 43 30 84 123 28 51 93 88 77 35 22 7 8 20 14 19 19 9

Rank 4 3 3 3 3 8 16 4 4 1 2 2 2 3 6 5 2 2 2 2 4

%ile 99 97 97 97 97 96 93 97 98 99 99 99 98 97 93 94 98 98 98 98 96

A L I G N M E N T S

Aligned Pairs Untrimmed RMS Trimmed RMS % Seq Identity Structure P-Value Sequence P-Value

FOLD
(General) 2214 7.31 2.32 18.62 1.82e-03 9.20e-01
Rank 2 73 47 171 58 55
%ile 99 66 78 21 73 75
FOLD (Exclusive) 1725 7.34 2.31 16.50 1.95e-08 9.99e-01
Rank 1 22 19 16 47 52
%ile 98 61 67 72 18 9
E X P R E S S I O N

Absolute Reference Genome Reference Transcriptome Wild-type (Jelinsky) Wild-type (Holstege) SAGE Mating-type (A) Mating-type (Alpha) GAL Heat Shock
% % E % E % E % E % E % E % E % E
Value 3.6 10.7 2.0 6.5 0.8 6.9 1.1 12.9 3.1 8.5 1.4 10.4 1.9 8.1 1.3 8.8 1.5
Rank 7 1 19 1 39 1 30 1 12 1 24 1 24 1 33 1 32
%ile 96 99 91 99 82 99 86 99 94 99 88 99 88 99 84 99 85
Ratio Reference Genome Reference Transcriptome CDC28 (Yeast) CDC15 (Yeast) Alpha (Yeast) Diauxic Shift (Yeast) Sporulation (Yeast) Heat Shock (E.coli) Development (Worm)
Value 0.06 0.04 0.10 0.28 0.34 0.24 0.48 0.83 1.06
Rank 142 133 117 53 57 38 38 24 91
Value 54 57 62 83 81 87 87 92 70
M I S C E L L A N E O U S

Rank %ile Year Identified Rank %ile

SIZE 332 46 89 AGE 76 404 4
Species 20 Aful Mjan Mthe Phor Scer Cele Aaeo Syne Ecol Bsub Mtub Hinf Hpyl Mgen Mpne Bbur Tpal Ctra Cpne Rpro

Occurrences:Size 2.584 0.136 0.114 0.130 0.090 0.253 0.370 0.084 0.154 0.280 0.265 0.232 0.105 0.066 0.021 0.036 0.060 0.045 0.057 0.057 0.027

Rank 14 8 6 7 9 15 35 8 9 6 7 7 8 8 16 8 4 6 4 4 21

%ile 96 94 95 94 92 93 86 95 95 97 96 96 95 94 83 91 96 94 96 96 84

List of identifiers associated with Fold 3.001.

d1a0ca_ d1a0cb_ d1a0cc_ d1a0cd_ d1a0da_ d1a0db_ d1a0dc_ d1a0dd_ d1a0ea_ d1a0ed_
d1a3wa2 d1a3wb2 d1a3xa2 d1a3xb2 d1a47_4 d1a5aa_ d1a5ba_ d1a5ca_ d1a5cb_ d1a5kc2
d1a5lc2 d1a5mc2 d1a5nc2 d1a5oc2 d1aa1b1 d1aa1e1 d1aa1h1 d1aa1l1 d1abn__ d1ad1a_
d1ad1b_ d1ad4a_ d1ad4b_ d1add__ d1adoa_ d1adob_ d1adoc_ d1adod_ d1ads__ d1ae4__
d1afsa_ d1afsb_ d1ag1o_ d1ag1t_ d1ah0__ d1ah3__ d1ah4__ d1aj0__ d1aj2__ d1ajz__
d1ak5__ d1al7__ d1al8__ d1ald__ d1amk__ d1amy_2 d1aod__ d1aq0a_ d1aq0b_ d1ausl1
d1aw1a_ d1aw1b_ d1aw1d_ d1aw1e_ d1aw1g_ d1aw1h_ d1aw1j_ d1aw1k_ d1aw2a_ d1aw2b_
d1aw2d_ d1aw2e_ d1aw2g_ d1aw2h_ d1aw2j_ d1aw2k_ d1az1__ d1az2__ d1bgaa_ d1bgab_
d1bgac_ d1bgad_ d1bgga_ d1bggb_ d1bggc_ d1bggd_ d1bgla5 d1bglb5 d1bglc5 d1bgld5
d1bgle5 d1bglf5 d1bglg5 d1bglh5 d1bgmi5 d1bgmj5 d1bgmk5 d1bgml5 d1bgmm5 d1bgmn5
d1bgmo5 d1bgmp5 d1bhga3 d1bhgb3 d1bpl.1 d1brla_ d1brlb_ d1bsla_ d1bslb_ d1btc__
d1btma_ d1btmb_ d1bura1 d1burb1 d1burc1 d1burd1 d1bya__ d1byb__ d1byc__ d1byd__
d1cbg__ d1cdg_4 d1cec__ d1cen__ d1ceo__ d1cgt_4 d1cgu_4 d1cgv_4 d1cgw_4 d1cgx_4
d1cgy_4 d1chra1 d1chrb1 d1ciu_4 d1clxa_ d1clxb_ d1clxc_ d1clxd_ d1cnv__ d1ctn_2
d1cwn__ d1cxe_4 d1cxf_4 d1cxg_4 d1cxh_4 d1cxi_4 d1cyg_4 d1dhka2 d1dhpa_ d1dhpb_
d1dida_ d1didb_ d1diea_ d1dieb_ d1dij_4 d1dik_1 d1djga3 d1djgb3 d1djha3 d1djhb3
d1djia3 d1djib3 d1djwa3 d1djwb3 d1djxa3 d1djxb3 d1djya3 d1djyb3 d1djza3 d1djzb3
d1dlaa_ d1dlab_ d1dlac_ d1dlad_ d1dora_ d1dorb_ d1dosa_ d1dosb_ d1dpma_ d1dpmb_
d1dtn_1 d1dxia_ d1dxib_ d1ebga1 d1ebgb1 d1ebha1 d1ebhb1 d1ecea_ d1eceb_ d1edg__
d1edt__ d1els_1 d1exp__ d1fbaa_ d1fbab_ d1fbac_ d1fbad_ d1fcb_1 d1fcba1 d1fdya_
d1fdyb_ d1fdyc_ d1fdyd_ d1fdza_ d1fdzb_ d1fdzc_ d1fdzd_ d1fkw__ d1fkx__ d1frb__
d1fvpa_ d1fvpb_ d1fwac2 d1fwbc2 d1fwcc2 d1fwdc2 d1fwec2 d1fwfc2 d1fwgc2 d1fwhc2
d1fwic2 d1fwjc2 d1ghr__ d1ghsa_ d1ghsb_ d1gowa_ d1gowb_ d1gox__ d1gyla_ d1gylb_
d1gym__ d1hny_2 d1htia_ d1htib_ d1hvq__ d1igs__ d1jda_2 d1jdc_2 d1jdd_2 d1juk__
d1jul__ d1kga__ d1krac2 d1krbc2 d1krcc2 d1lco_1 d1lcoa1 d1ldc_1 d1ldca1 d1llo__
d1ltd_1 d1ltda1 d1luca_ d1lucb_ d1lwia_ d1lwib_ d1mar__ d1mdl_1 d1mdr_1 d1ml1a_
d1ml1c_ d1ml1e_ d1ml1g_ d1ml1i_ d1ml1k_ d1mns_1 d1mra_1 d1mssa_ d1mssb_ d1muca1
d1mucb1 d1myr__ d1nal1_ d1nal2_ d1nal3_ d1nal4_ d1nar__ d1nel_1 d1nfp__ d1nsj__
d1onea1 d1oneb1 d1onra_ d1onrb_ d1ose_2 d1oya__ d1oyb__ d1oyc__ d1pama4 d1pamb4
d1pbga_ d1pbgb_ d1pdy_1 d1pdz_1 d1pif_2 d1pig_2 d1pii_1 d1pii_2 d1pkm_2 d1pkn_2
d1pkya2 d1pkyb2 d1pkyc2 d1pkyd2 d1ppi_2 d1psca_ d1pscb_ d1pta__ d1ptd__ d1ptg__
d1pud__ d1pyk_2 d1qapa1 d1qapb1 d1qasa3 d1qasb3 d1qata3 d1qatb3 d1qba_3 d1qbb_3
d1ral__ d1rbaa1 d1rbab1 d1rbla1 d1rbob1 d1rboe1 d1rboh1 d1rbol1 d1rcob1 d1rcoe1
d1rcoh1 d1rcok1 d1rcol1 d1rcoo1 d1rcor1 d1rcov1 d1rcxb1 d1rcxe1 d1rcxh1 d1rcxk1
d1rcxl1 d1rcxo1 d1rcxr1 d1rcxv1 d1reqa1 d1reqb1 d1reqc1 d1reqd1 d1rlcl1 d1rlda1
d1rldb1 d1rsca1 d1rusa1 d1rusb1 d1rxob1 d1rxoe1 d1rxoh1 d1rxol1 d1sfta2 d1sftb2
d1smd_2 d1tcma4 d1tcmb4 d1tima_ d1timb_ d1tmha_ d1tmhb_ d1tmhc_ d1tmhd_ d1tpb1_
d1tpb2_ d1tpc1_ d1tpc2_ d1tpda_ d1tpdb_ d1tpe__ d1tpfa_ d1tpfb_ d1tph1_ d1tph2_
d1tpua_ d1tpub_ d1tpva_ d1tpvb_ d1tpwa_ d1tpwb_ d1trda_ d1trdb_ d1trea_ d1treb_
d1tri__ d1tsia_ d1tsib_ d1tti__ d1ttj__ d1ttpa_ d1ttqa_ d1ubsa_ d1ucwa_ d1ucwb_
d1uio__ d1uip__ d1vjs_2 d1wkd__ d1wke__ d1wkf__ d1wsya_ d1xas__ d1xib__ d1xic__
d1xid__ d1xie__ d1xif__ d1xig__ d1xih__ d1xii__ d1xij__ d1xima_ d1ximb_ d1ximc_
d1ximd_ d1xina_ d1xinb_ d1xinc_ d1xind_ d1xis__ d1xkja_ d1xkjb_ d1xlaa_ d1xlab_
d1xlba_ d1xlbb_ d1xlca_ d1xlcb_ d1xlda_ d1xldb_ d1xlea_ d1xleb_ d1xlfa_ d1xlfb_
d1xlga_ d1xlgb_ d1xlha_ d1xlhb_ d1xlia_ d1xlib_ d1xlja_ d1xljb_ d1xlka_ d1xlkb_
d1xlla_ d1xllb_ d1xlma_ d1xlmb_ d1xyaa_ d1xyab_ d1xyba_ d1xybb_ d1xyca_ d1xycb_
d1xyla_ d1xylb_ d1xyma_ d1xymb_ d1xys__ d1xyza_ d1xyzb_ d1ydva_ d1ydvb_ d1ypia_
d1ypib_ d1zen__ d2aaa_2 d2acq__ d2acr__ d2acs__ d2acu__ d2ada__ d2alr__ d2amg_2
d2chr_1 d2ebn__ d2exo__ d2gyia_ d2gyib_ d2hvm__ d2isda3 d2isdb3 d2kauc2 d2mnr_1
d2myr__ d2onea1 d2oneb1 d2pbg__ d2plc__ d2ptd__ d2reqa1 d2reqb1 d2reqc1 d2reqd1
d2rusa1 d2rusb1 d2taaa2 d2tmda1 d2tmdb1 d2trsa_ d2tsya_ d2tysa_ d2xima_ d2ximb_
d2ximc_ d2ximd_ d2xina_ d2xinb_ d2xinc_ d2xind_ d2xis__ d2xyl__ d2ypia_ d2ypib_
d3cgt_4 d3enl_1 d3pbga_ d3pbgb_ d3ptd__ d3reqa1 d3reqb1 d3rubl1 d3tima_ d3timb_
d3xima_ d3ximb_ d3ximc_ d3ximd_ d3xina_ d3xinb_ d3xinc_ d3xind_ d3xis__ d3ypia_
d3ypib_ d4enl_1 d4pbga_ d4pbgb_ d4ptd__ d4ruba1 d4rubb1 d4rubc1 d4rubd1 d4tima_
d4timb_ d4xiaa_ d4xiab_ d4xima_ d4ximb_ d4ximc_ d4ximd_ d4xis__ d5enl_1 d5ptd__
d5ruba1 d5rubb1 d5tima_ d5timb_ d5xiaa_ d5xiab_ d5xima_ d5ximb_ d5ximc_ d5ximd_
d5xina_ d5xinb_ d5xinc_ d5xind_ d6enl_1 d6ptd__ d6taa_2 d6tima_ d6timb_ d6xia__
d6xima_ d6ximb_ d6ximc_ d6ximd_ d7enl_1 d7ptd__ d7tima_ d7timb_ d7xima_ d7ximb_
d7ximc_ d7ximd_ d8ruca1 d8rucc1 d8ruce1 d8rucg1 d8xia__ d8xima_ d8ximb_ d8ximc_
d8ximd_ d9ruba1 d9rubb1 d9xia__ d9xima_ d9ximb_ d9ximc_ d9ximd_ ds033__

Scop information.
RCSB PDB information.

fold_occurrences,858,4,99,#fde3e3,45,3,97,#fde3e3,37,3,97,#fde3e3,43,3,97,#fde3e3,30,3,97,#fde3e3,84,8,96,#fde3e3,123,16,93,#fde5e3,28,4,97,#fde3e3,51,4,98,#fde3e3,93,1,99,#fde3e3,88,2,99,#fde3e3,77,2,99,#fde3e3,35,2,98,#fde3e3,22,3,97,#fde3e3,7,6,93,#fde5e3,8,5,94,#fde5e3,20,2,98,#fde3e3,14,2,98,#fde3e3,19,2,98,#fde3e3,19,2,98,#fde3e3,9,4,96,#fde3e3,fold_alignmnents,2214,2,99,#fde3e3,7.31,73,66,#fdebe3,2.32,47,78,#fde8e3,18.62,171,21,#f7fde3,1.82e-03,58,73,#fdebe3,9.20e-01,55,75,#fde8e3,33,39,86,#e7fde3,3.59,140,49,#e3fdfa,0.57,150,45,#e3fdfa,48.80,28,90,#f7fde3,7.76e-29,190,30,#e3fdfa,9.52e-17,159,42,#e3fdfa,33,23,60,#fde5e3,3.59,105,-84,#fdfce3,0.57,103,-81,#fdfce3,48.80,37,35,#fde8e3,7.76e-29,156,-174,#effde3,9.52e-17,114,-100,#fafde3,1725,1,98,#fde3e3,7.34,22,61,#fdebe3,2.31,19,67,#fdebe3,16.50,16,72,#fde8e3,1.95e-08,47,18,#fdfce3,9.99e-01,52,9,#fafde3,0,91,-60,#eff6f3,.,91,23,#eff6f3,.,91,23,#eff6f3,.,91,23,#eff6f3,.,91,23,#eff6f3,.,91,23,#eff6f3,33,23,81,#e3fdfa,3.59,105,-10400,#e3fdfa,0.57,103,-10200,#e3fdfa,48.80,37,-3600,#e3fdfa,7.76e-29,156,-15500,#e3fdfa,,0,100,#fde3e3,expression_abs,3.6,7,96,#fde3e3,10.7,1,99,#fde3e3,2.0,19,91,#fde5e3,6.5,1,99,#fde3e3,0.8,39,82,#fdebe3,6.9,1,99,#fde3e3,1.1,30,86,#fde8e3,12.9,1,99,#fde3e3,3.1,12,94,#fde5e3,8.5,1,99,#fde3e3,1.4,24,88,#fde8e3,10.4,1,99,#fde3e3,1.9,24,88,#fde8e3,8.1,1,99,#fde3e3,1.3,33,84,#fdebe3,8.8,1,99,#fde3e3,1.5,32,85,#fdebe3,expression_ratio,0.06,142,54,#e7fde3,0.04,133,57,#ecfde3,0.10,117,62,#f3fde3,0.28,53,83,#fdeee3,0.34,57,81,#fdf4e3,0.24,38,87,#fdebe3,0.48,38,87,#fdebe3,0.83,24,92,#fde8e3,1.06,91,70,#fafde3,miscellaneous,332,46,89,#fde8e3,2.584,14,96,#fde3e3,0.136,8,94,#fde5e3,0.114,6,95,#fde5e3,0.130,7,94,#fde5e3,0.090,9,92,#fde5e3,0.253,15,93,#fde5e3,0.370,35,86,#fdebe3,0.084,8,95,#fde5e3,0.154,9,95,#fde5e3,0.280,6,97,#fde3e3,0.265,7,96,#fde3e3,0.232,7,96,#fde3e3,0.105,8,95,#fde5e3,0.066,8,94,#fde5e3,0.021,16,83,#fdebe3,0.036,8,91,#fde5e3,0.060,4,96,#fde3e3,0.045,6,94,#fde5e3,0.057,4,96,#fde3e3,0.057,4,96,#fde3e3,0.027,21,84,#fdebe3,76,404,4,#e3fdfa