Report on Structure d1yna_

Report on SCOP Fold corresponding to representative domain d1yna__ [SCOP 1.39 Fold 2.021]

Interaction Report for Fold 2.021

Function Classification

Augmented Flybase+ENZYME GenProtEC MIPS
d1yna__ E-3.2.1.8 NO NO

Rankings

O C C U R R E N C E S

Species 20 Aful Mjan Mthe Phor Scer Cele Aaeo Syne Ecol Bsub Mtub Hinf Hpyl Mgen Mpne Bbur Tpal Ctra Cpne Rpro

Number 55 0 3 0 1 7 36 0 2 0 3 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0

Rank 87 148 32 136 72 61 40 163 91 230 94 92 104 153 96 102 127 124 135 137 136

%ile 74 0 75 0 41 72 84 1 54 2 55 54 46 0 4 1 1 1 1 0 1

A L I G N M E N T S

Aligned Pairs Untrimmed RMS Trimmed RMS % Seq Identity Structure P-Value Sequence P-Value

FOLD
(General) 142 5.96 2.21 26.23 7.56e-02 6.17e-01
Rank 20 104 53 99 20 108
%ile 91 52 75 54 91 50
FOLD (Exclusive) 0 . . . . .
Rank 57 57 57 57 57 57
%ile 0 0 0 0 0 0
E X P R E S S I O N

Absolute Reference Genome Reference Transcriptome Wild-type (Jelinsky) Wild-type (Holstege) SAGE Mating-type (A) Mating-type (Alpha) GAL Heat Shock
% % E % E % E % E % E % E % E % E
Value 0.3 0.3 - 0.2 -0.3 0.4 0.2 0.1 -0.7 0.2 -0.3 0.2 -0.2 0.3 -0.1 0.2 -0.3
Rank 59 54 67 72 96 52 69 82 138 74 88 72 79 66 77 78 96
%ile 72 75 69 66 55 76 68 62 36 65 59 66 63 69 64 64 55
Ratio Reference Genome Reference Transcriptome CDC28 (Yeast) CDC15 (Yeast) Alpha (Yeast) Diauxic Shift (Yeast) Sporulation (Yeast) Heat Shock (E.coli) Development (Worm)
Value 0.29 0.22 0.15 0.33 0.47 0.27 0.25 0.48 -
Rank 62 58 97 33 17 29 132 61 218
Value 80 81 68 89 94 90 57 80 30
M I S C E L L A N E O U S

Rank %ile Year Identified Rank %ile

SIZE 203 142 66 AGE 75 413 2
Species 20 Aful Mjan Mthe Phor Scer Cele Aaeo Syne Ecol Bsub Mtub Hinf Hpyl Mgen Mpne Bbur Tpal Ctra Cpne Rpro

Occurrences:Size 0.271 0 0.015 0 0.005 0.034 0.177 0 0.010 0 0.015 0.010 0.005 0 0 0 0 0 0 0 0

Rank 110 148 48 136 93 79 53 164 112 234 109 121 158 153 100 103 128 125 136 137 137

%ile 67 1 63 1 24 63 78 1 44 0 48 40 18 1 1 1 1 1 1 1 1

List of identifiers associated with Fold 2.021.

d1a3k__ d1af9_1 d1ajka_ d1ajkb_ d1ajoa_ d1ajob_ d1apna_ d1apnb_ d1ax0__ d1ax1__
d1ax2__ d1axy__ d1axz__ d1azda_ d1azdb_ d1azdc_ d1azdd_ d1bcx__ d1byh__ d1cela_
d1celb_ d1cesa_ d1cesb_ d1cjpa_ d1cjpb_ d1cjpc_ d1cjpd_ d1cn1a_ d1cn1b_ d1cona_
d1cpm__ d1cpn__ d1cvna_ d1cvnb_ d1cvnc_ d1cvnd_ d1dhkb_ d1eg1a_ d1eg1c_ d1enqa_
d1enqb_ d1enqc_ d1enqd_ d1enr__ d1ensa_ d1ensb_ d1enxa_ d1enxb_ d1fata_ d1fatb_
d1fatc_ d1fatd_ d1gana_ d1ganb_ d1gbg__ d1gica_ d1gicb_ d1glh__ d1gnha_ d1gnhb_
d1gnhc_ d1gnhd_ d1gnhe_ d1gnhf_ d1gnhg_ d1gnhh_ d1gnhi_ d1gnhj_ d1gsl__ d1hlca_
d1hlcb_ d1ioaa_ d1ioab_ d1jbc__ d1kit_1 d1kit_2 d1lcl__ d1lec__ d1led__ d1lema_
d1lemb_ d1len.1 d1len.2 d1lesa_ d1lesb_ d1lesc_ d1lesd_ d1lgb.1 d1lgc.1 d1lgc.2
d1lgc.3 d1lgna_ d1lgnb_ d1lgnc_ d1lgnd_ d1lgne_ d1loa.1 d1loa.2 d1loa.3 d1loa.4
d1lob.1 d1lob.2 d1lob.3 d1lob.4 d1loc.1 d1loc.2 d1loc.3 d1loc.4 d1lod.1 d1lod.2
d1lod.3 d1lod.4 d1loe.1 d1loe.2 d1lof.1 d1lof.2 d1log.1 d1log.2 d1lte__ d1maca_
d1macb_ d1nls__ d1onaa_ d1onab_ d1onac_ d1onad_ d1ovwa_ d1ovwb_ d1ovwc_ d1ovwd_
d1reda_ d1redb_ d1reea_ d1reeb_ d1refa_ d1refb_ d1rin.1 d1rin.2 d1saca_ d1sacb_
d1sacc_ d1sacd_ d1sace_ d1sba__ d1sbd__ d1sbe__ d1sbf__ d1scr__ d1scs__ d1slaa_
d1slab_ d1slba_ d1slbb_ d1slbc_ d1slbd_ d1slca_ d1slcb_ d1slcc_ d1slcd_ d1slta_
d1sltb_ d1teia_ d1teib_ d1teic_ d1teid_ d1teie_ d1teif_ d1teig_ d1teih_ d1tepa_
d1tepb_ d1tepc_ d1tepd_ d1ukra_ d1ukrb_ d1ukrc_ d1ukrd_ d1vala_ d1valb_ d1valc_
d1vald_ d1vama_ d1vamb_ d1vamc_ d1vamd_ d1vlna_ d1vlnb_ d1vlnc_ d1vlnd_ d1vlne_
d1vlnf_ d1vlng_ d1vlnh_ d1wbla_ d1wblb_ d1wblc_ d1wbld_ d1xnb__ d1xnc__ d1xnd__
d1xyn__ d1xyoa_ d1xyob_ d1xypa_ d1xypb_ d1yna__ d2ayh__ d2cela_ d2celb_ d2cna__
d2ctva_ d2lal.1 d2lal.2 d2ltn.1 d2ltn.2 d2ovwa_ d2ovwb_ d2ovwc_ d2ovwd_ d2pela_
d2pelb_ d2pelc_ d2peld_ d3cel__ d3cna__ d3ovwa_ d3ovwb_ d4cela_ d4celb_ d4ovwa_
d4ovwb_ d5cel__ d5cnaa_ d5cnab_ d5cnac_ d5cnad_ d6cel__ d7cel__

Scop information.
RCSB PDB information.

fold_occurrences,55,87,74,#fdf4e3,0,148,0,#edf6f3,3,32,75,#fdf4e3,0,136,0,#edf6f3,1,72,41,#effde3,7,61,72,#fdf4e3,36,40,84,#fdebe3,0,163,1,#edf6f3,2,91,54,#f7fde3,0,230,2,#edf6f3,3,94,55,#f7fde3,2,92,54,#f7fde3,1,104,46,#f3fde3,0,153,0,#edf6f3,0,96,4,#edf6f3,0,102,1,#edf6f3,0,127,1,#edf6f3,0,124,1,#edf6f3,0,135,1,#edf6f3,0,137,0,#edf6f3,0,136,1,#edf6f3,fold_alignmnents,142,20,91,#fde5e3,5.96,104,52,#fdf4e3,2.21,53,75,#fde8e3,26.23,99,54,#fdf4e3,7.56e-02,20,91,#fde5e3,6.17e-01,108,50,#fdf4e3,142,13,95,#fdeee3,5.96,87,68,#e3fdfa,2.21,45,84,#e3fde6,26.23,110,60,#e3fdfa,7.56e-02,20,93,#fdfce3,6.17e-01,77,72,#e3fdfa,10,41,28,#fdebe3,3.09,113,-98,#fafde3,0.62,99,-74,#fdfce3,29.58,110,-93,#fafde3,1.87e-10,85,-49,#fdf7e3,2.42e-04,69,-21,#fdf4e3,0,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,74,8,86,#e3fdfa,5.53,50,58,#e3fdfa,1.90,34,71,#e3fdfa,15.31,73,38,#e3fdfa,1.56e-06,45,62,#e3fdfa,9.95e-01,72,39,#e3fdfa,10,41,65,#e3fdfa,3.09,113,-11200,#e3fdfa,0.62,99,-9800,#e3fdfa,29.58,110,-10900,#e3fdfa,1.87e-10,85,-8400,#e3fdfa,,0,100,#fde3e3,expression_abs,0.3,59,72,#fdf4e3,0.3,54,75,#fdf4e3,-,67,69,#edf6f3,0.2,72,66,#fdf7e3,-0.3,96,55,#fafde3,0.4,52,76,#fdeee3,0.2,69,68,#fdf7e3,0.1,82,62,#fdfce3,-0.7,138,36,#ecfde3,0.2,74,65,#fdf7e3,-0.3,88,59,#fafde3,0.2,72,66,#fdf7e3,-0.2,79,63,#fdfce3,0.3,66,69,#fdf7e3,-0.1,77,64,#fdfce3,0.2,78,64,#fdfce3,-0.3,96,55,#fafde3,expression_ratio,0.29,62,80,#fdf4e3,0.22,58,81,#fdf4e3,0.15,97,68,#fafde3,0.33,33,89,#fdebe3,0.47,17,94,#fde5e3,0.27,29,90,#fde8e3,0.25,132,57,#ecfde3,0.48,61,80,#fdf4e3,-,218,30,#e3fdfa,miscellaneous,203,142,66,#fdf7e3,0.271,110,67,#fdf7e3,0,148,1,#edf6f3,0.015,48,63,#fdfce3,0,136,1,#edf6f3,0.005,93,24,#e3fde6,0.034,79,63,#fdfce3,0.177,53,78,#fdeee3,0,164,1,#edf6f3,0.010,112,44,#effde3,0,234,0,#edf6f3,0.015,109,48,#f3fde3,0.010,121,40,#ecfde3,0.005,158,18,#e3fdea,0,153,1,#edf6f3,0,100,1,#edf6f3,0,103,1,#edf6f3,0,128,1,#edf6f3,0,125,1,#edf6f3,0,136,1,#edf6f3,0,137,1,#edf6f3,0,137,1,#edf6f3,75,413,2,#e3fdfa