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Report on SCOP Fold corresponding to representative domain d3cms__ [SCOP 1.39 Fold 2.038]

  Interaction Report for Fold 2.038

  Function Classification
 Augmented Flybase+ENZYMEGenProtECMIPS
d3cms__E-3.4.23.4
  Rankings
O C C U R R E N C E S
Species 20AfulMjanMthePhorScerCeleAaeoSyneEcolBsubMtubHinfHpylMgenMpneBburTpalCtraCpneRpro
Number 391001102500100000000000
Rank 1139112913672495316320015820920019115396102127124135137136
%ile 663800417778103300104111101
A L I G N M E N T S
  Aligned PairsUntrimmed RMSTrimmed RMS% Seq IdentityStructure P-ValueSequence P-Value 
FOLD
(General)
1074.590.8032.061.13e-068.08e-02
Rank 2714215771107152
%ile 883427675030
FOLD (Exclusive) 0.....
Rank 575757575757
%ile 000000
E X P R E S S I O N
Absolute Reference GenomeReference TranscriptomeWild-type (Jelinsky)Wild-type (Holstege)SAGEMating-type (A)Mating-type (Alpha)GALHeat Shock 
%%E%E%E%E%E%E%E%E
Value 0.40.2-0.60.3-0.40.2-0.50.80.70.4-0.10.3-0.30.4-0.20.50.3
Rank 4966133561057713526274970559152874352
%ile 7769387451643788877767745876598076
Ratio Reference GenomeReference TranscriptomeCDC28 (Yeast)CDC15 (Yeast)Alpha (Yeast)Diauxic Shift (Yeast)Sporulation (Yeast)Heat Shock (E.coli)Development (Worm)
Value 0.290.130.250.230.380.270.430.302.00
Rank 62865211140294711123
Value 807283648790856492
M I S C E L L A N E O U S
   Rank%ile Year IdentifiedRank%ile
SIZE 164 18157AGE8636812
Species 20AfulMjanMthePhorScerCeleAaeoSyneEcolBsubMtubHinfHpylMgenMpneBburTpalCtraCpneRpro
Occurrences:Size 0.2380.006000.0060.0610.152000.00600000.006000000
Rank 12210312913685495716420018720920019215369103128125136137137
%ile 6431113177771020001131111111
  List of identifiers associated with Fold 2.038.
d1a30a_ d1a30b_ d1a8ga_ d1a8gb_ d1a9ma_ d1a9mb_ d1aaqa_ d1aaqb_ d1aida_ d1aidb_
d1ajva_ d1ajvb_ d1ajxa_ d1ajxb_ d1am5__ d1apte_ d1apue_ d1apve_ d1apwe_ d1avf.1
d1avf.2 d1axaa_ d1axab_ d1az5__ d1bbs__ d1bila_ d1bilb_ d1bima_ d1bimb_ d1bvea_
d1bveb_ d1bvga_ d1bvgb_ d1cms__ d1cpia_ d1cpib_ d1czie_ d1difa_ d1difb_ d1dmpa_
d1dmpb_ d1eaga_ d1eedp_ d1ente_ d1eple_ d1epme_ d1epne_ d1epoe_ d1eppe_ d1epqe_
d1epre_ d1er8e_ d1fiva_ d1fmb__ d1gnma_ d1gnmb_ d1gnna_ d1gnnb_ d1gnoa_ d1gnob_
d1hbva_ d1hbvb_ d1hefe_ d1hege_ d1hhp__ d1hiha_ d1hihb_ d1hiia_ d1hiib_ d1hiva_
d1hivb_ d1hosa_ d1hosb_ d1hpoa_ d1hpob_ d1hpsa_ d1hpsb_ d1hpva_ d1hpvb_ d1hpxa_
d1hpxb_ d1hrna_ d1hrnb_ d1hsga_ d1hsgb_ d1hsha_ d1hshb_ d1hshc_ d1hshd_ d1hsia_
d1hsib_ d1htea_ d1hteb_ d1htfa_ d1htfb_ d1htga_ d1htgb_ d1htr.1 d1hvc__ d1hvia_
d1hvib_ d1hvja_ d1hvjb_ d1hvka_ d1hvkb_ d1hvla_ d1hvlb_ d1hvra_ d1hvrb_ d1hvsa_
d1hvsb_ d1hxba_ d1hxbb_ d1hxwa_ d1hxwb_ d1idaa_ d1idab_ d1idba_ d1idbb_ d1ivpa_
d1ivpb_ d1ivqa_ d1ivqb_ d1jlda_ d1jldb_ d1lya.1 d1lya.2 d1lyb.1 d1lyb.2 d1mera_
d1merb_ d1mesa_ d1mesb_ d1meta_ d1metb_ d1meua_ d1meub_ d1mpp__ d1mtra_ d1mtrb_
d1mvpa_ d1mvpb_ d1odwa_ d1odwb_ d1odxa_ d1odxb_ d1ppke_ d1pple_ d1ppme_ d1proa_
d1prob_ d1psaa_ d1psab_ d1psn__ d1psoe_ d1qbra_ d1qbrb_ d1qbsa_ d1qbsb_ d1qbta_
d1qbtb_ d1qbua_ d1qbub_ d1rne__ d1sbga_ d1sbgb_ d1sip__ d1siva_ d1sivb_ d1smea_
d1smeb_ d1smra_ d1tcwa_ d1tcwb_ d1tcxa_ d1tcxb_ d1upj__ d1ytga_ d1ytgb_ d1ytha_
d1ythb_ d1ytia_ d1ytja_ d1zap__ d2aida_ d2aidb_ d2apr__ d2asi__ d2er0e_ d2er6e_
d2er7e_ d2er9e_ d2fiva_ d2fivb_ d2hpea_ d2hpeb_ d2hpfa_ d2hpfb_ d2hvp__ d2jxra_
d2mipa_ d2mipb_ d2mipc_ d2mipd_ d2psg__ d2ren__ d2rmpa_ d2rspa_ d2rspb_ d2sam__
d2upja_ d2upjb_ d2wea__ d2web__ d2wec__ d2wed__ d3aida_ d3aidb_ d3app__ d3apre_
d3cms__ d3er3e_ d3er5e_ d3fiva_ d3fivb_ d3hvp__ d3pep__ d3phv__ d3psg__ d3upja_
d3upjb_ d4ape__ d4apre_ d4cms__ d4er1e_ d4er2e_ d4er4e_ d4hvpa_ d4hvpb_ d4pep__
d4phva_ d4phvb_ d4upja_ d4upjb_ d5apre_ d5er1e_ d5er2e_ d5hvpa_ d5hvpb_ d5pep__
d5upja_ d5upjb_ d6apre_ d6upja_ d6upjb_ d7hvpa_ d7hvpb_ d7upja_ d7upjb_ d8hvpa_
d8hvpb_ d9hvpa_ d9hvpb_

Scop information.
RCSB PDB information.
fold_occurrences,39,113,66,#fdf7e3,1,91,38,#ecfde3,0,129,0,#edf6f3,0,136,0,#edf6f3,1,72,41,#effde3,10,49,77,#fdeee3,25,53,78,#fdeee3,0,163,1,#edf6f3,0,200,0,#edf6f3,1,158,33,#e7fde3,0,209,0,#edf6f3,0,200,0,#edf6f3,0,191,1,#edf6f3,0,153,0,#edf6f3,0,96,4,#edf6f3,0,102,1,#edf6f3,0,127,1,#edf6f3,0,124,1,#edf6f3,0,135,1,#edf6f3,0,137,0,#edf6f3,0,136,1,#edf6f3,fold_alignmnents,107,27,88,#fde5e3,4.59,142,34,#fdfce3,0.80,157,27,#fafde3,32.06,71,67,#fdebe3,1.13e-06,107,50,#fdf4e3,8.08e-02,152,30,#fafde3,107,21,92,#fdfce3,4.59,117,57,#e3fdfa,0.80,127,53,#e3fdfa,32.06,82,70,#e3fdfa,1.13e-06,85,69,#e3fdfa,8.08e-02,117,57,#e3fdfa,21,30,47,#fde8e3,5.23,78,-37,#fdf4e3,0.71,90,-58,#fdf7e3,34.60,89,-56,#fdf7e3,2.29e-06,55,4,#fdeee3,3.07e-02,58,-2,#fdeee3,0,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,.,57,0,#eff6f3,8,41,28,#e3fdfa,4.94,57,52,#e3fdfa,1.62,54,54,#e3fdfa,10.47,90,24,#e3fdfa,9.13e-06,36,69,#e3fdfa,1,1,99,#e3fdfa,21,30,75,#e3fdfa,5.23,78,-7700,#e3fdfa,0.71,90,-8900,#e3fdfa,34.60,89,-8800,#e3fdfa,2.29e-06,55,-5400,#e3fdfa,,0,100,#fde3e3,expression_abs,0.4,49,77,#fdeee3,0.2,66,69,#fdf7e3,-0.6,133,38,#ecfde3,0.3,56,74,#fdf4e3,-0.4,105,51,#f7fde3,0.2,77,64,#fdfce3,-0.5,135,37,#ecfde3,0.8,26,88,#fde8e3,0.7,27,87,#fde8e3,0.4,49,77,#fdeee3,-0.1,70,67,#fdf7e3,0.3,55,74,#fdf4e3,-0.3,91,58,#fafde3,0.4,52,76,#fdeee3,-0.2,87,59,#fafde3,0.5,43,80,#fdeee3,0.3,52,76,#fdeee3,expression_ratio,0.29,62,80,#fdf4e3,0.13,86,72,#fdfce3,0.25,52,83,#fdeee3,0.23,111,64,#f3fde3,0.38,40,87,#fdebe3,0.27,29,90,#fde8e3,0.43,47,85,#fdeee3,0.30,111,64,#f3fde3,2.00,23,92,#fde8e3,miscellaneous,164,181,57,#fafde3,0.238,122,64,#fdfce3,0.006,103,31,#e3fde3,0,129,1,#edf6f3,0,136,1,#edf6f3,0.006,85,31,#e3fde3,0.061,49,77,#fdeee3,0.152,57,77,#fdeee3,0,164,1,#edf6f3,0,200,0,#edf6f3,0.006,187,20,#e3fdea,0,209,0,#edf6f3,0,200,0,#edf6f3,0,192,1,#edf6f3,0,153,1,#edf6f3,0.006,69,31,#e3fde3,0,103,1,#edf6f3,0,128,1,#edf6f3,0,125,1,#edf6f3,0,136,1,#edf6f3,0,137,1,#edf6f3,0,137,1,#edf6f3,86,368,12,#e3fdf1