Comparer for protein structure rankings
Qian, J. et.al (2001) Nucleic Acids Research 29: 1750-64
[First 30 records][Entire table]
[Display values][Display ranks]
Image size: [50][70][100][120]Q(foldonly)
P-value (seq. DE)F(cdc28)
fluctuation of expression levels in CDC28X(age)
year of fold determinedB(Ala,pdb100)
composition percentage of Ala for pdb100dJ(scerall, intra)
interaction on same chains [yeast]Max in column 1 0.91 98 23.0 44 Min in column 9.97E-01 0.05 72 1.3 1 Average 1.0 0.3 91.9 8.4 4.9 Non zero hits 56 126 420 420 111 Ranked folds (click on arrows to re-rank)
d1ap8__:. (1.39). - 97 4.7 44
d1aj2__:. (1.39)9.99E-01 0.1 76 10.0 23
d1qnf_2:. (1.39). - 95 10.9 20
d1cvl__:. (1.39). 0.23 90 8.5 20
d1tml__:. (1.39). . 90 13.8 18
d1dai__:. (1.39). 0.21 87 7.9 18
d1dst__:. (1.39). 0.15 75 6.6 15
d1dhs__:. (1.39). - 93 12.5 15
d2bnh__:. (1.39). 0.51 96 7.0 15
d3cms__:. (1.39). 0.25 86 5.4 14
d1aa7a_:. (1.39). . 97 8.2 14
d1alo_7:. (1.39). - 95 10.9 12
d1fuia2:. (1.39). - 97 12.1 12
d1fsz_1:. (1.39). - 97 9.1 12
d2frva_:. (1.39). - 96 9.1 11
d1orda3:. (1.39). - 95 7.5 10
d2masa_:. (1.39). - 95 10.8 10
d1rlr_2:. (1.39). 0.2 94 8.3 9
d1opy__:. (1.39)1 0.13 92 7.4 9
d1gnd_2:. (1.39). - 87 5.7 8
d1uag_2:. (1.39). - 97 10.7 8
d1fts_1:. (1.39). - 96 8.8 8
d2def__:. (1.39). - 96 7.1 8
d2nef__:. (1.39). . 96 4.7 6
d1gne_1:. (1.39). 0.23 92 6.6 6
d1ihp__:. (1.39). 0.31 82 7.0 6
d1ak4c_:. (1.39). . 96 8.0 5
d1cyx__:. (1.39). - 80 8.4 5
d1mek__:. (1.39). 0.36 76 7.1 5
d1tpt_2:. (1.39). - 90 12.5 5
d1xjo__:. (1.39)1 0.37 76 8.6 5
d1inp__:. (1.39). 0.07 90 8.8 5
d1aijh1:. (1.39). . 88 9.5 5
d1nox__:. (1.39). - 96 11.7 4
d1kwaa_:. (1.39). 0.24 96 6.7 4
d2rsla_:. (1.39). - 93 8.6 4
d1bw3__:. (1.39)1 - 92 11.0 4
d1rkd__:. (1.39)1 0.25 97 14.5 4
d1hcd__:. (1.39)1 0.29 89 4.5 4
d1nbaa_:. (1.39). - 92 10.2 4
d1a5j_1:. (1.39)9.97E-01 0.22 87 7.1 4
d1bvp11:. (1.39). - 95 11.6 4
d1bed_1:. (1.39). . 93 12.5 4
d1drw_2:. (1.39). 0.28 75 10.7 4
d1bno__:. (1.39). - 94 12.1 3
d2duba_:. (1.39). 0.12 96 10.6 3
d1jpc__:. (1.39). . 95 2.8 3
d1rvv1_:. (1.39). - 95 13.0 3
d1gc1g_:. (1.39). . 98 4.0 3
d1avma2:. (1.39). - 91 11.5 3
d1aua_1:. (1.39). 0.14 96 15.5 3
d1lay__:. (1.39). . 96 8.6 3
d2tysb_:. (1.39). - 88 10.8 3
d1agre_:. (1.39). 0.14 97 6.8 3
d1oroa_:. (1.39). 0.36 93 7.3 3
d1fim__:. (1.39). . 95 9.5 3
d1atia1:. (1.39). - 96 15.3 3
d1pex__:. (1.39). . 95 6.2 3
d2fmr__:. (1.39). 0.44 95 6.3 3
d1szt__:. (1.39). . 89 6.2 2
d1ak0__:. (1.39). . 97 10.9 2
d1cld__:. (1.39). - 92 5.3 2
d1clh__:. (1.39). 0.42 92 5.4 2
d1xsm__:. (1.39). 0.66 90 7.6 2
d1trka3:. (1.39). - 93 11.0 2
d1poib_:. (1.39). - 97 7.3 2
d2itg__:. (1.39)1 0.3 78 9.0 2
d1a1s_2:. (1.39). 0.23 82 10.5 2
d1tsg__:. (1.39). 0.19 91 7.1 2
d1nsya_:. (1.39)1 0.12 89 6.7 2
d1adt_3:. (1.39). . 95 9.5 2
d2prk__:. (1.39). 0.38 72 14.1 2
d3pmga3:. (1.39). - 95 8.8 2
d1mmq__:. (1.39)1 0.06 82 7.8 2
d2pia_2:. (1.39). 0.27 93 7.2 2
d1zqw__:. (1.39). - 93 3.0 2
d1dkza_:. (1.39). 0.23 96 11.4 2
d1prta_:. (1.39). - 92 7.8 2
d1tif__:. (1.39)1 0.09 87 5.9 2
d1lci__:. (1.39). 0.64 96 5.7 2
d1smpi_:. (1.39)1 . 92 13.0 2
d1ois__:. (1.39). - 96 4.9 1
d2cae__:. (1.39). - 83 6.9 1
d1toh__:. (1.39). 0.46 97 7.9 1
d1eny__:. (1.39). 0.28 74 10.6 1
d1ido__:. (1.39). 0.08 95 7.3 1
d2tct_2:. (1.39). . 94 10.6 1
d1kpta_:. (1.39). . 95 9.6 1
d1pysb2:. (1.39). - 96 8.6 1
d1hlm__:. (1.39). - 73 12.3 1
d1brsd_:. (1.39). - 93 8.4 1
d1msc__:. (1.39). . 94 11.7 1
d1har__:. (1.39). 0.11 87 5.9 1
d1pcfa_:. (1.39). 0.12 97 3.0 1
d1jud__:. (1.39). 0.71 96 13.4 1
d1ytfd1:. (1.39). - 96 6.8 1
d1a5t_1:. (1.39). - 98 13.4 1
d1aj3__:. (1.39)1 - 94 12.1 1
d1tis__:. (1.39). - 91 5.8 1
d1oaca4:. (1.39). - 95 9.0 1
d2aw0__:. (1.39)9.99E-01 0.19 76 8.1 1
d1al01_:. (1.39). . 97 12.5 1
d1aln_2:. (1.39). - 95 16.0 1
d2tct_1:. (1.39). - 94 8.8 1
d1adt_1:. (1.39). . 95 11.4 1
d1who__:. (1.39)1 0.24 91 2.5 1
d1caa__:. (1.39). 0.27 82 7.9 1
d1eur__:. (1.39). - 91 5.0 1
d1aora2:. (1.39). . 95 10.0 1
d1sfta1:. (1.39)1 - 96 6.3 1
d1xbl__:. (1.39)1 0.12 91 11.4 1
The images of protein structures were taken from www.rcsb.org
The classification of folds is from SCOP version 1.39
Questions, comments, and suggestions qian@csb.yale.edu